NASIL ÇALIŞIR

PrIMe, hedefe yönelik ve immüno-onkoloji tedavileriyle ilişkili 500+ genin analizi için kullanılan Oncomine Comprehensive Assay Plus testine dayanmaktadır. Bu test, TMB ve MSI’nin yanı sıra ilgili SNV’leri, eklenme veya çıkarılmaları, CNV’leri, gen füzyonlarını ve birleşme yeri varyantlarını eş zamanlı olarak tespit eder. Bu test, NCI MATCH gibi büyük klinik onkoloji çalışmalarında etkinliği kanıtlanmış sağlam performansıyla orijinal testin yeni, geliştirilmiş versiyonudur.

Dizileme, Next Generation Sequencing platformu Ion GeneStudio™ S5 Prime System (Thermo Fisher Scientific) kullanılarak gerçekleştirilmektedir. SNV, Eklenme veya Çıkarılma ve CNV analizindeki test performansına dair ayrıntılar için lütfen bkz. Tablo I.

TMB analizinin akreditasyonu iki aşamada yapılmıştır:

1. PrIMe’nin TMB testi, in siliko olarak WES (Bütün Genom Dizileme) ile karşılaştırılmıştır. Bu karşılaştırma WES ve PrIMe arasında yüksek korelasyon göstermiştir.

2. PrIMe TMB testi, hasta numuneleri kullanılarak piyasada satılan başka bir testle kıyaslanmıştır; bu kıyaslama da TMB’nin tespit edilmesinde yüksek korelasyon göstermiştir.

Tablo I. Test performansı

Referans kontrolde test performansı

CNV’de test performansı